Des travaux d'aménagement faunique sont régulièrement effectués dans la réserve faunique du Saint-Maurice. Ces efforts visent à restaurer la population de truites indigènes de certains lacs notamment par l'aménagement de frayères.
La forêt de la réserve faunique du Saint-Maurice est exploitée par l'industrie forestière en vertu d'un contrat d'approvisionnement et d'aménagement forestier (CAAF) accordé par le ministère des Ressources naturelles et de la Faune du Québec. La Sépaq fait tout en son pouvoir pour que ces pratiques de l'industrie soient harmonisées avec les activités offertes dans la réserve faunique. Elle recommande notamment des mesures pour minimiser les impacts potentiels sur la faune, la biodiversité, le paysage et l'ambiance entourant les activités récréatives.
Un territoire de 42,6 km2 a été mis en réserve pour l'implantation d'une aire protégée, celle de la Vallée-Tousignant située dans la MRC Mékinak.
Une bleuetière commerciale biologique devrait éventuellement être créée dans le secteur du lac Soucis.