Un parc national est créé pour protéger des milieux naturels représentatifs ou particuliers et des paysages d'une région. Ces territoires doivent aussi être mis en valeur par l'interprétation du patrimoine naturel et culturel et par des activités de plein air extensives. Les enjeux de conservation découlent alors de la recherche de l'équilibre entre la protection et l'accessibilité de ces aires protégées.
Le mandat du parc marin du Saguenay–Saint-Laurent est de rehausser le niveau de protection des écosystèmes d’une partie représentative du fjord du Saguenay et de l’estuaire du Saint-Laurent aux fins de conservation, tout en favorisant son utilisation à des fins éducatives, récréatives et scientifiques, au profit des générations actuelles et futures.
Selon les principes de l’utilisation écologiquement durable, les écosystèmes doivent être utilisés en tenant compte de leurs limites à procurer des services et des ressources. En ce sens, l’approche écosystémique préconise de tenir compte de la capacité des ressources marines à se renouveler, de protéger les espèces en péril et leur habitat, et de réduire les impacts des activités humaines sur la structure et les fonctions des écosystèmes. Les gestionnaires du parc marin jouent principalement un rôle d’influence auprès des organismes responsables des activités qui ont cours sur le territoire du parc marin.
Appelé baleine blanche, marsouin blanc ou canari des mers, le béluga fascine depuis toujours. Avec sa peau blanche et son front proéminent, il est facilement reconnaissable parmi les autres mammifères marins.

Un béluga
Le béluga du Saint-Laurent réside à l’année dans l’estuaire et le golfe du Saint-Laurent et fréquente le fjord du Saguenay en saison estivale. Ce mammifère curieux, bavard et grégaire est menacé de disparition depuis quelques décennies déjà. La principale cause du déclin de cette espèce est la chasse qui eut cours jusqu’au XXe siècle. La pollution fut et est encore une cause importante de la situation précaire du béluga du Saint-Laurent. Afin de maintenir une population viable de ce mammifère dans le Saint-Laurent, un plan de rétablissement a été mis en place. Véritable symbole environnemental au Québec, le béluga se trouve à l’origine même de la création du parc marin du Saguenay–Saint-Laurent!