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Les poissons
 Les agnathes
Les agnathes sont des poissons sans mâchoires qui constituent les plus anciens vertébrés apparus dans l'évolution des espèces. Quatre espèces se rattachent à ce groupe. Ce sont Endeiolepis aneri, Euphanerops longaevus, Escuminaspis laticeps, Levesquaspis patteni.
 Les placodermes
Les placodermes sont des poissons à carapaces osseuses, très présents dans les eaux dévoniennes, qui ont complètement disparu à la fin de la période. Ils sont représentés à Miguasha par les espèces Bothriolepis canadensis et Plourdosteus canadensis.
 Les acanthodiens
Les acanthodiens sont de petits poissons qui possèdent des épines rigides en position ventrale et en position dorsale. Diplacanthus ellsi, Diplacanthus horridus, Homalacanthus concinnus, Triazeugacantus affinis sont les quatre espèces d'acanthodiens de Miguasha.
 Les actinoptérygiens
Les poissons osseux à nageoires rayonnées comprennent la plus grande partie des poissons actuels avec près de 29 000 espèces. Cheirolepis canadensis de Miguasha figure parmi les plus anciens représentants de ce groupe.
 Les sarcoptérygiens
Ce sont des sarcoptérygiens, ce groupe de poissons à nageoires lobées, qui ont assuré la transition entre le milieu aquatique et le milieu terrestre chez les vertébrés. Doté de poumons et de structures osseuses dans les nageoires paires, le poisson Eusthenopteron foordi a été, pendant un siècle, considéré comme un chaînon entre les poissons et les tétrapodes.
Avec huit espèces, ce groupe est particulièrement bien représenté à Miguasha avec Miguashaia bureaui, Scaumenacia curta, Fleurantia denticulata, Holoptychius jarviki, Quebecius quebecensis, Eusthenopteron foordi, Callistiopterus clappi et Elpistostege watsoni.
Les invertébrés
La faune d'invertébrés de Miguasha compte l'un des plus vieux scorpions terrestres connus. Il s'agit de Petaloscorpio bureaui, dont la longueur pouvait atteindre 30 centimètres. En 2003, la découverte d'un mille-pattes fossile a constitué une première en 125 ans de fouilles. Les mille-pattes sont les premiers animaux à avoir fait la conquête du milieu terrestre. Des scorpions aquatiques, soit des euryptérides d'un mètre de long, figurent aussi parmi les autres espèces d'invertébrés de la
Formation d'Escuminac.
 Flore fossile
La flore fossile comprend une dizaine d'espèces de plantes et plus de 70 espèces de spores. Très présent, le genre Archaeopteris compose les premières forêts à l'époque dévonienne. Atteignant plus de sept mètres de haut, cet arbre primitif qui se reproduisait encore par spores, est considéré comme un chaînon intermédiaire menant aux conifères et aux plantes à graines.
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